Думаю да, можно ввести переменную, которач будет отражать версию текущую, потом записывать ее в файл.ини а при запуске игры проверить, находим последние две строки, если нжняя > верхней, то удаляем префсы.

Можно еще сделать подключение из бд сайта

Стандартными средствами нет, но с помощью шейдера с альфа каналом текстур можно, но вроде шейдеры с альфой для терраина только на про, если не ошибаюсь.
Попробуй на кряке сделать